BioHack

Хакатон по биоинформатике
2 – 4 марта 2018 | Санкт-Петербург
о мероприятии
BioHack — хакатон для команд биологов и программистов по решению прикладных задач в области биоинформатики в течение 48 часов
Цели хакатона
  • популяризация биоинформатики в России
  • междисциплинарное общение молодых специалистов технических и биологических направлений
  • формирование биоинформатического сообщества в Санкт-Петербурге
  • развитие перспективных идей и IT-решений в области биологии и современной медицины
Подробности
  • хакатон длится 48 часов: с пятницы по воскресенье
  • размер команд от 3 до 5 человек
  • окончательное распределение по командам — в день открытия хакатона после презентаций проектов
  • организаторы обеспечивают всех участников полноценным питанием, комфортными условиями для работы и круглосуточным доступом к площадке
пОБЕДИТЕЛИ BIOHACK 2018
1 место|100 000 |команда Good Vibrations

Станислав Наумов,
Александр Кислюк,
Севастьян Рабдано,
Сергей Беломестных,
Кирилл Быков

Проект: Анализ звукопродукции дрозофилы
Руководитель: Геннадий Захаров

2 место|70 000 |команда m(олот)TORa

Герман Осьмак,
Пётр Цуринов,
Пётр Болотин,
Артём Ильин,
Наталия Сухих

Проект: Регуляция сигнального пути mTOR факторами плюрипотентности
Руководитель: Николай Панюшев

3 место|50 000 |команда No PasaRAN!

Дмитрий Смирнов,
Ярослав Соловьев,
Алёна Кизенко,
Лаврентий Данилов,
Наталья Родина

Проект: Поиск возможных сайтов RAN трансляции
Руководитель: Антон Бондаренко


Специальный приз, команда AUsome

Александра Малышева,
Станислав Беляев,
Юрий Ребрик,
Георгий Новиков,
Ирина Пахомова

Проект: Разработка метода оценки предполагаемой клинической значимости вариаций при помощи методов машинного обучения
Руководитель: Геннадий Захаров

Специальный приз
, команда Phage in rage

Антон Шиков,
Ольга Бойченко,
Андрей Цибин,
Екатерина Белякова,
Вадим Данилов

Проект: Бактериофаги в метагеномах крови человека
Руководитель: Елизавета Старикова

Специальный приз, команда .bedcode corporation

Денис Клеверов,
Максим Клеверов,
Роман Бельтюков,
Любовь Курафеева,
Александра Галицына

Проект: Предсказание 3D организации структуры хромосомы
Руководитель: Сергей Колченко
FAQ
Кто может принять участие в хакатоне?
Мы приглашаем студентов средних и старших курсов, аспирантов, выпускников вузов, интересующихся биоинформатикой, имеющих знания в области биологии, либо умеющих программировать. Неважно, какие проекты вы делали до этого. Мы ждем всех, кто не боится трудностей и готов разработать готовый проект за 48 часов.

Требуется ли знание каких-то специальных технологий и языков программирования?
Нет. Мы ждем специалистов, имеющих достаточный опыт на любом языке программирования.

Как зарегистрироваться на хакатон?
Для регистрации необходимо заполнить заявку на каждого участника индивидуально. При выборе участников мы будем обращать внимание на мотивационное письмо, которое вы должны будете написать в заявке. Регистрация открыта до 19 февраля.

Итоговый список участников будет опубликован на сайте 20 февраля.
Как выбрать проект?
20 февраля всем участникам, прошедшим отбор, придет письмо с инструкцией о том, как можно выбрать проект. На проект можно зарегистрироваться командой. Окончательное распределение по проектам будет в день открытия хакатона.
Есть какие-то направления или ограничения по тематике проектов?
Темы проектов из любой области биоинформатики и смежных областей. В каждой команде в идеале будут присутствовать как биологи, так и программисты, поэтому для решения задач понадобятся знания из обеих областей.

Можно подать свой проект?
Вы можете подать собственный проект, на реализацию которого у вас никак не находилось времени. Зарегистрировать проект можно с помощью этой формы до 19 февраля.

Можно ли участвовать в хакатоне своей командой?
К сожалению, нет. Все заявки на участие проходят индивидуальный отбор на общих основаниях. В случае, если все члены вашей команды пройдут отбор, то вероятность участия в одном проекте высокая, но гарантировать мы не можем.

Сколько длится хакатон?
BioHack длится 48 часов.
Хакатон стартует в пятницу, 2 марта, в 16:00. Презентации разработанных проектов пройдут в воскресенье, 5 марта, с 14:00 до 18:00. Организаторы обеспечат комфортные условия для работы и круглосуточный доступ к площадке.

Обязательно работать над проектом все время на площадке?
Вы вправе выбирать количество времени, которое будете находиться на площадке и работать. Если работать в таком режиме для вас экстремально — можете отправиться домой или поспать в оборудованном для сна месте на площадке в любое время.
Что необходимо принести с собой?
Инструменты для работы
  • Ноутбук и зарядное устройство к нему.
  • Расходные материалы, которые могут понадобиться.
Мероприятие предполагает, что каждый сам принесет все, что ему будет необходимо для работы, но вы можете координироваться с другими участниками.

Личные вещи
  • Все участники будут обеспечены полноценным питанием и напитками, но если вы придерживаетесь особого питания, то его лучше взять с собой.
  • Если вы планируете ночевать на площадке, возьмите спальный мешок или надувной матрас и гигиенические принадлежности (например, зубную щетку).
*Нажимая на кнопку, вы даете согласие на обработку персональных данных и соглашаетесь c политикой конфиденциальности
видео
Как проходил первый BioHack 2017
Организаторы
BioHack — совместный проект международной IT-компании ЕРАМ и Института биоинформатики.
Основанная в 1993 году компания EPAM является глобальным разработчиком программного обеспечения и поставщиком цифровых платформ. Объединяя свыше 22000 профессионалов, компания работает с клиентами по всему миру, используя свои отмеченные наградами центры разработки и офисы в 25 странах Северной Америки, Европы, Азии, Австралии.

В 2015 году EPAM получил главный приз от Bio-IT World на конкурсе лучших проектов в сфере медицины и биотехнологий. Компетенции компании включают в себя разработку программного обеспечения в области биоинформатики и хемоинформатики, внедрение корпоративных платформ и платформ для медицинского обслуживания, проведение аналитики, разработку эффективных алгоритмов для анализа больших данных.
Некоммерческая организация, занимается подготовкой высококвалифицированных специалистов в области биоинформатики и популяризацией биоинформатического знания в России.

Миссия Института — становление России как мирового исследовательского центра в области биоинформатики.

Помимо ежегодных образовательных программ, Институт биоинформатики проводит регулярные мероприятия для состоявшихся специалистов, как биологического, так и технического профиля, которые желают повысить свою квалификацию и получить актуальные знания.

В 2015 году в Институте открылось исследовательское подразделение.
место проведения
Офис ЕРАМ на Заставской, 22А,
бизнес-центр «МегаПарк».
Санкт-Петербург
Заставская 22А

МегаПарк
Информационные партнеры
Вопросы?
Если у вас остались вопросы — пишите нам:
info@biohack.ru